世界F1H2O摩托艇锦标赛正赛每场约40分钟，通常在湖泊、河流、码头或避风的海湾举行，每场比赛前十名选手将获得积分，其中冠军20分，亚军15分，季军12分，之后依次为9分、7分、5分、4分、3分、2分和1分，直至第十名。
作为2024年及以后赛季的一项新创新，每场大奖赛还将举办两场冲刺赛，其中起跑阵容由排位赛位置决定，2025年的参赛赛手分为两组，每组十名。每位冲刺赛完赛者都会获得积分，从预赛冠军得10分，到第10名得1分。
